RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCORP1Q8N888 145 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RDH11Q8TC12 318 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 METTL6Q8TCB7 284 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C19orf60Q96EN9 201 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C5orf34Q96MH7 638 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DGAT2Q96PD7 388 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM237Q96Q45 408 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF382Q96SR6 550 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.61□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR10H2O60403 315 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ULK1O75385 1050 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZFAND5O76080 213 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RASAL1O95294 804 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDYNP01213 254 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLK1P06870 262 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TUBBP07437 444 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUDT17P0C025 328 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NR2F6P10588 404 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNLYP22749 145 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BSGP35613 385 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PKNOX1P55347 436 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNFRSF17Q02223 184 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCP2Q13094 533 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NR6A1Q15406 480 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF766Q5HY98 468 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZYG11AQ6WRX3 759 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AMER2Q8N7J2 671 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MORN4Q8NDC4 146 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRHL3Q8TE85 626 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAVIN3Q969G5 261 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCLNQ969V3 563 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM125Q96AQ2 219 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 L3HYPDHQ96EM0 354 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BRF2Q9HAW0 419 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANKRD10Q9NXR5 420 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ESPL1Q14674 2120 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TENM4Q6N022 2769 aa11.6□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0A6YYD5 115 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C17orf105B2RV13 164 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BQF6 201 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP6CO00743 305 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PROM1O43490 865 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ETHE1O95571 254 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GBAP04062 536 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PROCP04070 461 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ENO1P06733 434 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSD3B1P14060 373 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPA3P15088 417 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSD3B2P26439 372 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STT3AP46977 705 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYB561P49447 251 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAPK12P53778 367 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLIN5Q00G26 463 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ID2Q02363 134 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FOLH1Q04609 750 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ASPHQ12797 758 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TUBA3CQ13748 450 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1C1Q15619 314 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FHL5Q5TD97 284 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C18orf63Q68DL7 685 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSDL2Q6YN16 418 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4N5Q8IXE1 308 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM156Q8N614 296 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ART5Q96L15 291 aa11.59□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms