RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 E7EQ34 232 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CSTAP01040 98 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MLLT10P55197 1068 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R43P59537 309 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CES4AQ5XG92 561 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMC10Q8N2F6 343 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SNTA1Q13424 505 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGGQ5H8A4 983 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 XKR5Q6UX68 686 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8K5Q8NH50 307 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CITED4Q96RK1 184 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 LBX1P52954 281 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PON2Q15165 354 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR34Q9UPC5 381 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CA3P07451 260 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CBLP22681 906 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GATSQ8NAP1 163 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RBP7Q96R05 134 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF4P08620 206 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CHAF1BQ13112 559 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 LCN8Q6JVE9 175 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATC1Q76KD6 591 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TGM7Q96PF1 710 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 EHD1Q9H4M9 534 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MAN2B1O00754 1011 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF208O43345 1280 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR1AP08908 422 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMP1P11279 417 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PDX1P52945 283 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MOGQ16653 247 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TM4SF4P48230 202 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB103AP81534 67 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SMU1Q2TAY7 513 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC36A3Q495N2 470 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR26Q8NDV2 337 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 NENFQ9UMX5 172 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SOCS7O14512 581 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ETFAP13804 333 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GGT1P19440 569 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9A3P48764 834 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB2AP61019 212 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RCAN2Q14206 197 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 IER5LQ5T953 404 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT10Q86SR1 603 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GID4Q8IVV7 300 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKFN1Q8N957 763 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 APIPQ96GX9 242 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CHIAQ9BZP6 476 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HCRTR2O43614 444 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAPPC6AO75865 159 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RHCEP18577 417 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 AASSQ9UDR5 926 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNJ13O60928 360 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN3P20807 821 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms