RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 FEZF1A0PJY2 475 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TLR4O00206 839 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CCRL2O00421 344 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 OR10H3O60404 316 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CCNKO75909 580 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 AP2A2O94973 939 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF30P17039 623 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TNNI3P19429 210 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PSMB5P28074 263 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF45Q02386 682 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PLAG1Q6DJT9 500 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CACUL1Q86Y37 369 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 GPR65Q8IYL9 337 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 SLC38A5Q8WUX1 472 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM19Q96HH6 336 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 MRGPRX3Q96LB0 322 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 MVB12BQ9H7P6 319 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 SMURF1Q9HCE7 757 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ANKHQ9HCJ1 492 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TIGARQ9NQ88 270 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CLN6Q9NWW5 311 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 NOTCH4Q99466 2003 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PPM1DO15297 605 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PTTG1O95997 202 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ALPPL2P10696 532 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 BCL2A1Q16548 175 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 LIPKQ5VXJ0 399 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC190Q86UF4 302 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 NLRP8Q86W28 1048 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TCEANCQ8N8B7 351 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 IL17RDQ8NFM7 739 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 OR5D16Q8NGK9 328 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 SLC5A11Q8WWX8 675 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ING5Q8WYH8 240 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 DEFB118Q96PH6 123 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 F2RL3Q96RI0 385 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CEP44Q9C0F1 390 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CARD8Q9Y2G2 431 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PEX16Q9Y5Y5 336 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 M0R3H8 397 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF197O14709 1029 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 DYRK3O43781 588 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 NME6O75414 186 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 SOD1P00441 154 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CXCL10P02778 98 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 FHP07954 510 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ITGA2P17301 1181 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 SOX6P35712 828 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 DAB2P98082 770 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 NOGQ13253 232 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 PDE7AQ13946 482 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 BAK1Q16611 211 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 FBXO43Q4G163 708 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CRB2Q5IJ48 1285 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 LAS2Q8IYD9 372 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 IRF7Q92985 503 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CTRCQ99895 268 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 NEK6Q9HC98 313 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 IL36AQ9UHA7 158 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.4□□□□□ -0.26
CNGA3-204ENST00000409937 REV3LO60673 3130 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 HBQ1P09105 142 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 PTNP21246 168 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 SSTR4P31391 388 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 MMP12P39900 470 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 SLC15A1P46059 708 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM60Q495X7 471 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 C11orf96Q7Z7L8 435 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 AMER3Q8N944 861 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 SLC30A2Q9BRI3 323 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 PRR14Q9BWN1 585 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.39□□□□□ -0.27
CNGA3-204ENST00000409937 MMP28Q9H239 520 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms