RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NEK5Q6P3R8 708 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RINLQ6ZS11 566 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 DET1Q7L5Y6 550 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SNX32Q86XE0 403 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MIER2Q8N344 545 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 AADATQ8N5Z0 425 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TSPEARQ8WU66 669 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MOCOSQ96EN8 888 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 COX14Q96I36 57 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SERPINI1Q99574 410 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NTMT1Q9BV86 223 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 DPH1Q9BZG8 443 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 AIG1Q9NVV5 245 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ASIC5Q9NY37 505 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PDE10AQ9Y233 779 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GTQ1 180 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CHUKO15111 745 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 INPP4BO15327 924 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TAPBPO15533 448 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR4F21O95013 312 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 GUCA1CO95843 209 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MT-CO3P00414 261 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 PRPH2P23942 346 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LSSP48449 732 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KRT6CP48668 564 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ADPRHP54922 357 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TAS2R38P59533 333 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FOXM1Q08050 763 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 STX5Q13190 355 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RCAN2Q14206 197 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 TMEM198Q66K66 360 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 REP15Q6BDI9 236 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 VRK3Q8IV63 474 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 EID2Q8N6I1 236 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR2L2Q8NH16 312 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ASB12Q8WXK4 309 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 USP7Q93009 1102 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ROPN1LQ96C74 230 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.26□□□□□ -1.41
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