RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396352.8

HOXA3-202, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA3, Length 3,263 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-202ENST00000396352 V9GYH0 126 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-202ENST00000396352 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 LRG1P02750 347 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CKMT1AP12532 417 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 OSMP13725 252 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TYRP14679 529 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CD72P21854 359 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.026e-6■□□□□ 10.1
HOXA3-202ENST00000396352 GRIN2CQ14957 1233 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 BCL7AQ4VC05 210 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 LIPIQ6XZB0 460 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ASB15Q8WXK1 588 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NEK6Q9HC98 313 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SOX14O95416 240 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 APOA1P02647 267 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 PTPN2P17706 415 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 UCK2Q9BZX2 261 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CCNKO75909 580 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SLITRK5O94991 958 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SOD1P00441 154 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ELFN1P0C7U0 828 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 IRS1P35568 1242 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TIE1P35590 1138 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CRYBB2P43320 205 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 C12orf73Q69YU5 71 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TP53INP1Q96A56 240 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CEP19Q96LK0 163 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 IL36AQ9UHA7 158 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 BCHEP06276 602 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ILKQ13418 452 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SAXO2Q658L1 398 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ERAP2Q6P179 960 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 GPR151Q8TDV0 419 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 IRF7Q92985 503 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 DYRK4Q9NR20 520 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ASAH2Q9NR71 780 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 MFN2O95140 757 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 HTR3AP46098 478 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 OR2B6P58173 313 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 COPZ1P61923 177 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NEURL3Q96EH8 262 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NLNQ9BYT8 704 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 RGS13O14921 159 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 HBQ1P09105 142 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 GPR50Q13585 617 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SPHARQ15513 63 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF79Q15937 498 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TMEM80Q96HE8 168 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-202ENST00000396352 TTC36A6NLP5 189 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms