RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395727.6

PTPN20-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN20, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN20-208	ENST00000395727	CDC16	Q13042	620 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TGFBI	Q15582	683 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SYT16	Q17RD7	645 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CEP97	Q8IW35	865 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	BCORP1	Q8N888	145 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PDPR	Q8NCN5	879 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	M1AP	Q8TC57	530 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	GRHL3	Q8TE85	626 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	NR4A3	Q92570	626 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	LPAR4	Q99677	370 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	LUZP4	Q9P127	313 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ABI3	Q9P2A4	366 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SNX24	Q9Y343	169 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	RELN	P78509	3460 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MAST4	O15021	2626 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A088AWK7	358 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ESYT3	A0FGR9	886 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SGK494	L7N484	410 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	JRK	O75564	520 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SCEL	O95171	688 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	GUCA1C	O95843	209 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	STMN1	P16949	149 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SERPINB1	P30740	379 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SSTR1	P30872	391 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	STX2	P32856	288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CASP2	P42575	452 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	GLRB	P48167	497 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ARFIP1	P53367	373 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC12A2	P55011	1212 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PER3	P56645	1201 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ARG2	P78540	354 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	GUCY2D	Q02846	1103 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	NSDHL	Q15738	373 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TBCC	Q15814	346 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MEP1A	Q16819	746 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	DEFB134	Q4QY38	66 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC5A8	Q8N695	610 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MDS2	Q8NDY4	140 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ELP5	Q8TE02	316 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	RELT	Q969Z4	430 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	MOCOS	Q96EN8	888 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PTPN20-208	ENST00000395727	C5orf34	Q96MH7	638 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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