RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384227.1

RNU6-1201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1201P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GOT1P17174 413 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GABRB1P18505 474 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CTNNA2P26232 953 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HOXD10P28358 340 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PPP2R1AP30153 589 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 XCR1P46094 333 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CLDN17P56750 224 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ROR1Q01973 937 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRKCDQ05655 676 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BAMBIQ13145 260 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BIRC3Q13489 604 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DPYSL3Q14195 570 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GRB14Q14449 540 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NPTX1Q15818 432 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RAET1LQ5VY80 246 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SULT1C3Q6IMI6 304 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DHRS11Q6UWP2 260 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 AACSQ86V21 672 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LAX1Q8IWV1 398 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCDC146Q8IYE0 955 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF100Q8IYN0 542 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ELMOD1Q8N336 334 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MTURNQ8N3F0 131 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SYT14Q8NB59 555 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DCUN1D4Q92564 292 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HTRA1Q92743 480 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MYDGFQ969H8 173 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC25A38Q96DW6 304 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CCDC136Q96JN2 1154 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TSNARE1Q96NA8 513 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NDNQ99608 321 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SEPHS2Q99611 448 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NICN1Q9BSH3 213 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CNPY3Q9BT09 278 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SLC2A11Q9BYW1 496 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPNS1Q9H2V7 528 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EQTNQ9NQ60 294 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 EXOC1Q9NV70 894 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DPM3Q9P2X0 92 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SCML2Q9UQR0 700 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PDE10AQ9Y233 779 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PPIAL4AQ9Y536 164 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DOCK9Q9BZ29 2069 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 A0A096LNJ9 63 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 A0A1W2PPH5 198 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LRRD1A4D1F6 860 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRABD2BA6NFA1 517 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LIPT2A6NK58 231 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PSMD3O43242 534 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MBD4O95243 580 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ECDO95905 644 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CD4P01730 458 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 FCGR3AP08637 254 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SP9P0CG40 484 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ADRB3P13945 408 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NPR2P20594 1047 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 HNF1AP20823 631 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DNASE1P24855 282 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CALML3P27482 149 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 UGT1A3P35503 534 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TGFBR1P36897 503 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KLHL30Q0D2K2 578 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SBK1Q52WX2 424 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ODF2Q5BJF6 829 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM211Q6ICI0 200 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRR27Q6MZM9 219 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 NANOGP8Q6NSW7 305 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 KLHL35Q6PF15 583 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 TMEM26Q6ZUK4 368 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 CHST9Q7L1S5 443 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 ZNF429Q86V71 674 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DNAAF5Q86Y56 855 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PRSS35Q8N3Z0 413 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 PDILTQ8N807 584 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1201P-201ENST00000384227 SPATA5Q8NB90 893 aa-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms