RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PADI2Q9Y2J8 665 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO7Q9Y3I1 522 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMED3Q9Y3Q3 217 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADGRL1O94910 1474 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 LNP1A1A4G5 178 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRD1A4D1F6 860 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM166BA8MTA8 275 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 A8MU76 341 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 B9A039 149 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM150CB9EJG8 249 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPIPA3F8WFD2 350 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 GFYI3L273 518 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLDN4O14493 209 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPHP1O15259 732 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIGLEC5O15389 551 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGEB2O15479 319 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLOD3O60568 738 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RTN2O75298 545 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLN5O75503 358 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPAN9O75954 239 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM63AO94886 807 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 VAMP5O95183 116 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEMA4FO95754 770 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCGB1D1O95968 90 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMP1P03956 469 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC3BP05452 202 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 HCKP08631 526 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLTBP09497 229 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB40ALP0C0E4 278 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINGO3P0C6S8 592 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DANCRP0C864 163 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR2MP0CAP2 368 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZCCHC18P0CG32 403 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 THRBP10828 461 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT3P12035 628 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPCAMP16422 314 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP11B2P19099 503 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNF1AP20823 631 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCNE1P24864 410 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 HTR1EP28566 365 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 GABRA5P31644 462 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA4P34932 840 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NF2P35240 595 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIR2DS4P43632 304 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRKLP46109 303 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 LHX1P48742 406 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CAV2P51636 162 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGDIBP52566 201 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF131P52739 623 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 METAP1P53582 386 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPK12P53778 367 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MFAP2P55001 183 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDH8P55286 799 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUP107P57740 925 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPL32P62910 135 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CXCL9Q07325 125 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL10RBQ08334 325 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNTN1Q12860 1018 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RALGDSQ12967 914 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLAQ13239 276 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 BIRC3Q13489 604 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 VEZF1Q14119 521 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 BECN1Q14457 450 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPS6KA1Q15418 735 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 EXT1Q16394 746 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNAPC1Q16533 368 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD55Q3KP44 614 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 COX19Q49B96 90 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPR33Q49SQ1 333 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHLDA2Q53GA4 152 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNLZQ5SXM8 178 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPATA46Q5T0L3 261 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT79Q5XKE5 535 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 RFWD3Q6PCD5 774 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL35Q6PF15 583 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYP20A1Q6UW02 462 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 ENPP7Q6UWV6 458 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-187P-201ENST00000384139 MFSD7Q6UXD7 560 aa0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms