RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 I3L521 148 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 POU2F1P14859 743 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 POU1F1P28069 291 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 VIPR1P32241 457 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NSG1P42857 185 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS5P46782 204 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC9A3P48764 834 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 DGKEP52429 567 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF234Q14588 700 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KIAA0040Q15053 153 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ESCO2Q56NI9 601 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PYDC2Q56P42 97 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GLRX5Q86SX6 157 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZSWIM9Q86XI8 627 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SIGLEC11Q96RL6 698 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF121Q9H920 327 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ABCB9Q9NP78 766 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NEU3Q9UQ49 428 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 HS3ST2Q9Y278 367 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ASF1AQ9Y294 204 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RFXANKO14593 260 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 C1QCP02747 245 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 STATHP02808 62 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CTSEP14091 401 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 M6PRP20645 277 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CDKN2CP42773 168 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 IRF8Q02556 426 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC14A1Q13336 389 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR33Q49SQ1 333 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SUSD1Q6UWL2 747 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KRT73Q86Y46 540 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 HMGB4Q8WW32 186 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SCRN2Q96FV2 425 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MYADMQ96S97 322 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 POLHQ9Y253 713 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MED16Q9Y2X0 877 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 B4DXG7 233 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PLK4O00444 970 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PCCBP05166 539 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MMP2P08253 660 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TSPAN19P0C672 248 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GNPDA1P46926 289 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PRIM2P49643 509 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 EPHA5P54756 1037 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF79Q15937 498 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GLCCI1Q86VQ1 547 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MDGA1Q8NFP4 955 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PEX13Q92968 403 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PMEPA1Q969W9 287 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 DIRAS2Q96HU8 199 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GDF15Q99988 308 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 LRTM1Q9HBL6 345 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 FKBP14Q9NWM8 211 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.7□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ULK1O75385 1050 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OTCP00480 354 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ETV3P41162 512 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ETV6P41212 452 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MAGEA2P43356 314 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB25P57735 213 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ABHD18Q0P651 414 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CDH24Q86UP0 819 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 LRIG1Q96JA1 1093 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 FEVQ99581 238 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PDFQ9HBH1 243 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TSC2P49815 1807 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 FABP12A6NFH5 140 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 A8MUA0 341 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OR7A17O14581 309 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GPX5O75715 221 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 C9P02748 559 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF30P17039 623 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SOX3P41225 446 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 HYAL2Q12891 473 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 25.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NFATC2Q13469 925 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TATDN3Q17R31 274 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms