RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373201.5

PTPRT-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-207ENST00000373201 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ARVCFO00192 962 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SLC34A2O95436 690 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 EDN3P14138 238 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TSHRP16473 764 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CD36P16671 472 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PRPS1L1P21108 318 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 MELKQ14680 651 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 AWAT2Q6E213 333 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SUN5Q8TC36 379 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TRBC2A0A5B9 178 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TPSB2P20231 275 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 LCN1P31025 176 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FOLR3P41439 243 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TPSAB1Q15661 275 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 KCNK18Q7Z418 384 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FCGR1BQ92637 280 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OPA3Q9H6K4 179 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TPRA1Q86W33 373 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 RAD9AQ99638 391 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 RHCGQ9UBD6 479 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SLC9A3P48764 834 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 RGS6P49758 472 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 MALSU1Q96EH3 234 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 LRRTM2O43300 516 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ASGR2P07307 311 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 GSTM3P21266 225 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 STK35Q8TDR2 534 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 DDIT4LQ96D03 193 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 GINS3Q9BRX5 216 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 NRP1O14786 923 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ACOX3O15254 700 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 NDUFV2P19404 249 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PTPN6P29350 595 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FXYD4P59646 89 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PLD5Q8N7P1 536 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FKRPQ9H9S5 495 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OXSMQ9NWU1 459 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FNIP2Q9P278 1114 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ECI2O75521 394 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 RP2O75695 350 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 HLA-DQB2P05538 268 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 GRIA1P42261 906 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 KCNC4Q03721 635 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ARL14Q8N4G2 192 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 GIMAP5Q96F15 307 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OR51B5Q9H339 312 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 NPBWR1P48145 328 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 MZT1Q08AG7 82 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 RPA4Q13156 261 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CCL14Q16627 93 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 TRIB2Q92519 343 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 LRFN1Q9P244 771 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 YIPF1Q9Y548 306 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 H7BY64 318 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 ST3GAL3Q11203 375 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 PON2Q15165 354 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 OR52W1Q6IF63 320 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 BBS10Q8TAM1 723 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-207ENST00000373201 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms