RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 OR1E2P47887 323 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 DYRK3O43781 588 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 SOX6P35712 828 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 P2RY2P41231 377 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE7AQ13946 482 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 Q96MT0 163 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 CDCA4Q9BXL8 241 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 DYRK4Q9NR20 520 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 ASF1AQ9Y294 204 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-201ENST00000369862 COL4A3Q01955 1670 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 VEGFDO43915 354 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 IL12RB1P42701 662 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFA1P59665 94 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFA3P59666 94 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 C2orf80Q0P641 193 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SCARB2Q14108 478 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC80Q76M96 950 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SMARCD2Q92925 531 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 DPP7Q9UHL4 492 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 HCN2Q9UL51 889 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 ALPK3Q96L96 1907 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 KLK1P06870 262 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 HSMCR30P0CW71 290 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS2R50P59544 299 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CARTPTQ16568 116 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SPANXN2Q5MJ10 180 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 MYNNQ9NPC7 610 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL3Q9UH77 587 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CFL2Q9Y281 166 aa22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 TRANK1O15050 2925 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CASP3P42574 277 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CRISP3P54108 245 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC42P60953 191 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4F2P78329 520 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTN1Q12860 1018 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 FGF13Q92913 245 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 COX14Q96I36 57 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3D21A4FU49 640 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3CBP42338 1070 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PDZD3Q86UT5 571 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 MMP21Q8N119 569 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PPCDCQ96CD2 204 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PIP5K1AQ99755 562 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PI15O43692 258 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 MPZL2O60487 215 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR37L1O60883 481 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 XCR1P46094 333 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 LIMS1P48059 325 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 HMGA2P52926 109 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 GDPD3Q7L5L3 318 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC190Q86UF4 302 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM129CQ86XR2 697 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 OXR1Q8N573 874 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 NFKBIDQ8NI38 313 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3R3Q92569 461 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 LGR4Q9BXB1 951 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms