RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TBK1Q9UHD2 729 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FBN2P35556 2912 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 A1L4Q6 167 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 H3BQF6 201 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CYR61O00622 381 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FCHO1O14526 889 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 COPEO14579 308 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 UGDHO60701 494 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A12O75746 678 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NEURL1O76050 574 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SCELO95171 688 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TGFB1P01137 390 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GCAP28676 217 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CRHR1P34998 444 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3CBP42338 1070 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CLCN2P51788 898 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RAP1GDS1P52306 607 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PER3P56645 1201 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK10P57789 538 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PHEXP78562 749 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2H2Q13888 395 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KRT71Q3SY84 523 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf17Q53FE4 359 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LIPJQ5W064 366 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GFRALQ6UXV0 394 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RNF175Q8N4F7 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.15□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NCLNQ969V3 563 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 VMP1Q96GC9 406 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SCMH1Q96GD3 660 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SMC6Q96SB8 1091 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CENPKQ9BS16 269 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OR51B5Q9H339 312 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 IPPKQ9H8X2 491 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF358Q9NW07 568 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MKS1Q9NXB0 559 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 LRFN1Q9P244 771 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 XPR1Q9UBH6 696 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SPACA6W5XKT8 324 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.15□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.15□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TLDC2A0PJX2 215 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 WIPF3A6NGB9 483 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM23A6NLE4 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 H0YIV9 168 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 PLPP1O14494 284 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CDK2AP1O14519 115 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR7A17O14581 309 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LRRTM2O43300 516 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CTNSO60931 367 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LDB3O75112 727 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 UNC5CO95185 931 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SHBGP04278 402 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA16P05015 189 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SP1P08047 785 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 KRT4P19013 534 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CPN2P22792 545 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MST1P26927 711 aa7.14□□□□□ -1.27
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