RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 NPBWR1P48145 328 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 LSSP48449 732 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 RASSF2P50749 326 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ARFIP1P53367 373 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 HYAL2Q12891 473 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 IL24Q13007 206 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SLC29A2Q14542 456 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 INPP5AQ14642 412 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 MSS51Q4VC12 460 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 TMEM31Q5JXX7 168 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 C22orf39Q6P5X5 142 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SLC51BQ86UW2 128 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CDK20Q8IZL9 346 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SMYD1Q8NB12 490 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FAM122AQ96E09 287 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 MRGPRX2Q96LB1 330 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SLC6A18Q96N87 628 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CLPBQ9H078 707 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 RUBCNLQ9H714 662 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 GPAMQ9HCL2 828 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 POLE4Q9NR33 117 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SELENONQ9NZV5 590 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 GNG8Q9UK08 70 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ACACAQ13085 2346 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 A0A0G2JND7 137 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ISPDA4D126 451 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 GJE1A6NN92 205 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CENPBD1B2RD01 187 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 AURKAO14965 403 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 B4GALT2O60909 372 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PIAS1O75925 651 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 IFNA21P01568 189 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 IL1BP01584 269 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 F7P08709 466 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 GSTM1P09488 218 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 G6PDP11413 515 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 DRD3P35462 400 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ARSFP54793 590 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 WNT3AP56704 352 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 IRX4P78413 519 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CRADDP78560 199 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 TNFRSF17Q02223 184 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 EPS8Q12929 822 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PMS2P3Q13401 168 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 SEMA5AQ13591 1074 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 LRRC32Q14392 662 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CSHL1Q14406 222 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 UBXN2BQ14CS0 331 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 DGUOKQ16854 277 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FOXB2Q5VYV0 432 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 BHLHB9Q6PI77 547 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 TTLQ8NG68 377 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 STOML3Q8TAV4 291 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 POC1BQ8TC44 478 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ADAMTS15Q8TE58 950 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 TCEAL3Q969E4 200 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ECHDC3Q96DC8 303 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CERS2Q96G23 380 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 CLUHP3Q96NS8 147 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 FCRL5Q96RD9 977 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PIP5K1AQ99755 562 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ZPBPQ9BS86 351 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PCDHAC1Q9H158 963 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 RMND5AQ9H871 391 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 ZNF160Q9HCG1 818 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-201ENST00000334268 PRSS16Q9NQE7 514 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms