RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC15Q8TF66 581 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PPL8 197 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR11A4FU01 709 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PIRO00625 290 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR17Q13304 367 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HS3ST5Q8IZT8 346 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CD8B2A6NJW9 211 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 H7BY64 318 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GRID2O43424 1007 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CD8BP10966 210 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAP1Q96NZ9 151 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NANSQ9NR45 359 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK13-1Q9NX77 482 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf71A8MTZ7 269 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 S1PR4O95977 384 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MPC1LP0DKB6 136 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF550Q7Z398 422 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RANBP9Q96S59 729 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FUNDC2Q9BWH2 189 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM185BQ9H7F4 350 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNN3Q9UGI6 736 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PPK0 400 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HNF1BP35680 557 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKN2DP55273 166 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTC1P68032 377 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTA1P68133 377 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 56.2
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP4Q8WY91 577 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MAFIPQ8WZ33 124 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TDP1Q9NUW8 608 aa23.2■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTM2P28161 218 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 KDELR2P33947 212 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 LSAMPQ13449 338 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NFE2L1Q14494 772 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ENPP6Q6UWR7 440 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 LHFPL3Q86UP9 236 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF584Q8IVC4 421 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RBP7Q96R05 134 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C9J4A7 227 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CD9P21926 228 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PLGLB1Q02325 96 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 KANK2Q63ZY3 851 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DCDC5Q6ZRR9 648 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 WASF3Q9UPY6 502 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 S1PR1P21453 382 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB11FIP2Q7L804 512 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2B3O76000 313 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 MECP2P51608 486 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CLRN1P58418 232 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GAS6Q14393 721 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf94Q6P1W5 598 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 P4HA3Q7Z4N8 544 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DNASE1P24855 282 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEA11P43364 429 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM151AQ8N4L1 468 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 MGAT4CQ9UBM8 478 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CPED1A4D0V7 1026 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 LEFTY2O00292 366 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK10Q15131 360 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC58Q4VC31 144 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SCRN2Q96FV2 425 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC1A7O00341 560 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 MYF6P23409 242 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC11A1P49279 550 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TEAD2Q15562 447 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF285Q96NJ3 590 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 A8MU76 341 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SOCS5O75159 536 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A12P80511 92 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PRRT3Q5FWE3 981 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms