RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294613.9

TM2D1-201, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D1, Length 1,250 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-201ENST00000294613 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CLCN2P51788 898 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CCNG1P51959 295 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SLAMF1Q13291 335 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 RCN2Q14257 317 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TEX35Q5T0J7 233 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 C18orf63Q68DL7 685 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 REPS1Q96D71 796 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 MTBPQ96DY7 904 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM237Q96Q45 408 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 NTMT1Q9BV86 223 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 LRFN1Q9P244 771 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FETUBQ9UGM5 382 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF225Q9UK10 706 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PPT2Q9UMR5 302 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.07■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ASPDHA6ND91 283 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 WIPF3A6NGB9 483 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 GOLGA8RI6L899 631 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 NME2P1O60361 137 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 DDAH2O95865 285 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SHBGP04278 402 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 GP1BBP13224 206 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 NME2P22392 152 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CPN2P22792 545 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 HLCSP50747 726 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PHEXP78562 749 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CUL3Q13618 768 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FRG2Q64ET8 278 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 C5orf34Q96MH7 638 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FRG2BQ96QU4 278 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 A0A1W2PS29 197 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 A1L4Q6 167 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ITGA10O75578 1167 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 UNC5CO95185 931 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 AIFM1O95831 613 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 GBAP04062 536 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 IFNA16P05015 189 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SP1P08047 785 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TNFRSF8P28908 595 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ARFIP1P53367 373 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CDH13P55290 713 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FOLH1Q04609 750 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 STX4Q12846 297 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 GPR180Q86V85 440 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 NUDT13Q86X67 352 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 OR14A16Q8NHC5 309 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SLC2A12Q8TD20 617 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CENPKQ9BS16 269 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 TBK1Q9UHD2 729 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PHF11Q9UIL8 331 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 EMCNQ9ULC0 261 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ASB4Q9Y574 426 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SPACA6W5XKT8 324 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CELSR2Q9HCU4 2923 aa16.05■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 ITPR2Q14571 2701 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 A0A1W2PR48 441 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 C17orf105B2RV13 164 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 HRKO00198 91 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 FCHO1O14526 889 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SEMA3DO95025 777 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CLDN1O95832 211 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CRYABP02511 175 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 STSP08842 583 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 NR2F6P10588 404 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CD46P15529 392 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 STT3AP46977 705 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 CYB561P49447 251 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 HERVK_113P63132 956 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 SERTAD2Q14140 314 aa16.04■□□□□ 0.16
TM2D1-201ENST00000294613 C4orf17Q53FE4 359 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms