RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 IRF9Q00978 393 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 FAPQ12884 760 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ARSHQ5FYA8 562 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 RNF220Q5VTB9 566 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 KAZALD1Q96I82 304 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CASD1Q96PB1 797 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 AKR1C2P52895 323 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 HYAL2Q12891 473 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ASB15Q8WXK1 588 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 RAB7BQ96AH8 199 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ACSS2Q9NR19 701 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 YIPF1Q9Y548 306 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 C2orf72A6NCS6 295 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 UNCXA6NJT0 531 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CD63P08962 238 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 RNF130Q86XS8 419 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PP18 115 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 M0R233 179 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 MAFKO60675 156 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CLDN7O95471 211 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CSTAP01040 98 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 QPCTQ16769 361 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 REEP4Q9H6H4 257 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 PHYHO14832 338 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 TNCP24821 2201 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 KCNJ13O60928 360 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 KCNJ11Q14654 390 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 FAAHO00519 579 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 TNFSF4P23510 183 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 EPGNQ6UW88 154 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 PEX13Q92968 403 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 DDIT4LQ96D03 193 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 EFCAB7A8K855 629 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 TOR1BO14657 336 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 MPPED1O15442 326 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 PRKCGP05129 697 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 IFI30P13284 250 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 PLGLAQ15195 96 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ZNF649Q9BS31 505 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 INPPL1O15357 1258 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CDRT1O95170 752 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 FASLGP48023 281 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 STC1P52823 247 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ZNF404Q494X3 552 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 CARD17Q5XLA6 110 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 WDR45Q9Y484 360 aa8.98□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 DNM1LO00429 736 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 GRID2O43424 1007 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 DNAJB5O75953 348 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 MMP27Q9H306 513 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 LIPT1Q9Y234 373 aa8.97□□□□□ -0.97
CUX1-201ENST00000292535 NPC1O15118 1278 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms