RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ANKRD28O15084 1053 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ITM2AO43736 263 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 GNB3P16520 340 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 JAM2P57087 298 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 DHCR24Q15392 516 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 NNATQ16517 81 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CCL14Q16627 93 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 PHC2Q8IXK0 858 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 A0A0A6YYH2 397 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 OR6C6A6NF89 314 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 A6NJ64 397 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SUSD3Q96L08 255 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.83■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CD72P21854 359 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ACADVLP49748 655 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 RHDQ02161 417 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LBX2Q6XYB7 198 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SGCZQ96LD1 299 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 COPZ2Q9P299 210 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 P04436 131 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 GSTM4Q03013 218 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 BCL2A1Q16548 175 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 GPR157Q5UAW9 335 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF773Q6PK81 442 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ARL14Q8N4G2 192 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 NUP43Q8NFH3 380 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LRRN3E7EW58 273 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LSSP48449 732 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 REEP3Q6NUK4 255 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CD244Q9BZW8 370 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KCNK13Q9HB14 408 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 YIPF1Q9Y548 306 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 TPPPO94811 219 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 IL3P08700 152 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SPTBP11277 2137 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 GALPQ9UBC7 116 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LYPLA2O95372 231 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ADORA3P0DMS8 318 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 JUPP14923 745 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 AOC1P19801 751 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KCND1Q9NSA2 647 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 H7BY64 318 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 HLA-DPB1P04440 258 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 OR4D2P58180 307 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 TRAM1Q15629 374 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 NTRK2Q16620 822 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ASB15Q8WXK1 588 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CGREF1Q99674 301 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 OXSMQ9NWU1 459 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.82■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CLCA1A8K7I4 914 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM198Q66K66 360 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SSX3Q99909 188 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 EBF2Q9HAK2 575 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SHMT2P34897 504 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 DLSTP36957 453 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 SLC18A2Q05940 514 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 PTTG2Q9NZH5 202 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 GJE1A6NN92 205 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 IFNA4P05014 189 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 PTP4A2Q12974 167 aa15.81■□□□□ 0.12
LAMC1-201ENST00000258341 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms