RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 MANEAQ5SRI9 462 aa21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SAXO2Q658L1 398 aa21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 GALNT10Q86SR1 603 aa21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NEURL3Q96EH8 262 aa21.45■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CLOCKO15516 846 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ALOX12P18054 663 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NTSP30990 170 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CTSKP43235 329 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NRF1Q16656 503 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.44■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 A0A1B0GTW7 788 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 MYO1GB0I1T2 1018 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SOCS2O14508 198 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ZNF682O95780 498 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 29
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RNF170-201ENST00000240159 BNIP3Q12983 259 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PMS2CLQ68D20 193 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SLC25A45Q8N413 288 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 BBS4Q96RK4 519 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 TMEM38AQ9H6F2 299 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 OAZ3Q9UMX2 235 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 VCANP13611 3396 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 H0YJX3 145 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 LAMTOR5O43504 91 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 B3GALT2O43825 422 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 B4GALT2O60909 372 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NR2F6P10588 404 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 FOLH1Q04609 750 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 RBBP4Q09028 425 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 RUNX2Q13950 521 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 EDAQ92838 391 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 MAP3K3Q99759 626 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 BDH2Q9BUT1 245 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PHF11Q9UIL8 331 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PADI4Q9UM07 663 aa21.43■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 TMEM131Q92545 1883 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 DNAJB6O75190 326 aa21.42■■□□□ 1.02
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RNF170-201ENST00000240159 C9P02748 559 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PRIM2P49643 509 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 LIM2P55344 173 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 BNC1Q01954 994 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 TNFRSF17Q02223 184 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ZNF750Q32MQ0 723 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CBR4Q8N4T8 237 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 NTN4Q9HB63 628 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ENTPD4Q9Y227 616 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 SCN3AQ9NY46 2000 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PDLIM1O00151 329 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ACOX3O15254 700 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 PRSS23O95084 383 aa21.41■■□□□ 1.02
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RNF170-201ENST00000240159 CRYBA2P53672 197 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 DUSP2Q05923 314 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 CBLL1Q75N03 491 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 VPS50Q96JG6 964 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 ZNF597Q96LX8 424 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 C9orf16Q9BUW7 83 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 STARD5Q9NSY2 213 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 DAPP1Q9UN19 280 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 C7orf72A4D263 438 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 C8orf89P0DMQ9 161 aa21.41■■□□□ 1.02
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RNF170-201ENST00000240159 CPN2P22792 545 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 AQP1P29972 269 aa21.41■■□□□ 1.02
RNF170-201ENST00000240159 GPC1P35052 558 aa21.41■■□□□ 1.02
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