RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Riok2Q9CQS5 547 aa13□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem9Q9CR23 183 aa13□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2610042L04RikQ9D073 150 aa13□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r29Q9EQ41 303 aa13□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa13□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ap1arE9PYF7 298 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ikzf3O08900 507 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ChadO55226 358 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MedagQ14BA6 303 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Apcdd1Q3U128 514 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kxd1Q80XH1 177 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp418Q8BFS8 652 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mief1Q8BGV8 463 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mptx1Q8R1M8 219 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1Q8VGI1 314 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Snx11Q91WL6 271 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nuf2Q99P69 463 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sugt1Q9CX34 336 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DstnQ9R0P5 165 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TesminQ9WTJ6 475 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PtprsB0V2N1 1907 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smok4aA0JLX3 433 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam217bA2AJW5 387 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1215A3KGY3 312 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20547B8JJN0 1276 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5475D3YV11 175 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif28pD3YXS5 1028 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dhcr7O88455 471 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk16O88697 305 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CfbP04186 761 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gsta2P10648 222 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2e3P52483 207 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sox9Q04887 507 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem181aQ3U3W2 474 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hephl1Q3V1H3 1159 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdk6Q64261 326 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1045Q7TR80 315 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr128Q7TRJ1 308 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Carnmt1Q80UY1 400 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arl15Q8BGR6 204 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fjx1Q8BQB4 450 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Peli2Q8BST6 419 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 E330021D16RikQ8BW45 371 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bpifb2Q8C1E1 462 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scamp1Q8K021 338 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Neto1Q8R4I7 533 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr853Q8VGG6 305 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TympQ99N42 471 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cby3Q9CVN6 235 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PudpQ9D5U5 234 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sertad3Q9ERC3 197 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plscr3Q9JIZ9 296 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 UxtQ9WTZ0 157 aa12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BC034090A0A087WP46 1202 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr59B1ARL3 323 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r91E9Q2U5 856 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Man2b2O54782 1018 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zp2P20239 713 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tacr2P30549 384 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc19a1P41438 512 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EvlP70429 414 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bcl2a1Q07440 172 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prss55Q14BX2 321 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Riiad1Q3KNY5 119 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Jmjd8Q3TA59 316 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp30Q3UN04 517 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prkd1Q62101 918 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssr4Q62186 172 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1308Q7TQX0 320 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc39a9Q8BFU1 308 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pomt2Q8BGQ4 820 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8BH50 245 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9881Q8BR56 211 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dpep2Q8C255 478 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fmo2Q8K2I3 535 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr380Q8VGT3 311 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Metap1dQ9CPW9 335 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Khdrbs2Q9WU01 349 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lhx9Q9WUH2 397 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdc7Q9Z0H0 564 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H60cB1B213 197 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EllO08856 602 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vti1bO88384 232 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GfapP03995 430 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam98aQ3TJZ6 515 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Satb1Q60611 764 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Itih2Q61703 946 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cfap206Q6PE87 622 aa12.98□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igsf5Q7TSN7 370 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25 ms