RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 IFT46Q9NQC8 304 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 KLK14Q9P0G3 267 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 DRGXA6NNA5 263 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC19A2O60779 497 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GJB3O75712 270 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 CNMDO75829 334 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 CLDN9O95484 217 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 AMD1P17707 334 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 F8A1P23610 371 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ITPKAP23677 461 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 BTCP35070 178 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 BDKRB1P46663 353 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 CDH12P55289 794 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAG2P55895 527 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 DHODHQ02127 395 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 MXD1Q05195 221 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAP4K2Q12851 820 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ILKQ13418 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GPR176Q14439 515 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 C22orf42Q6IC83 251 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SCD5Q86SK9 330 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIP5K1AQ99755 562 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RNF39Q9H2S5 420 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR51B5Q9H339 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 HACL1Q9UJ83 578 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 A0A1W2PPL8 197 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 C2orf81A6NN90 581 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 A8MXK9 166 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ISM1B1AKI9 464 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TLR4O00206 839 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC25A27O95847 323 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADAP00813 363 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIRTP0C851 137 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 EPB42P16452 691 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 KELP23276 732 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PCSK1P29120 753 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GABRA5P31644 462 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 MC4RP32245 332 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 MBTPS1Q14703 1052 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RGNQ15493 299 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TIGD4Q8IY51 512 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR2T4Q8NH00 348 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 FGF11Q92914 225 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 NXPE2Q96DL1 559 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SGTBQ96EQ0 304 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 LINC00052Q96N35 136 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TSSK3Q96PN8 268 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 FZD4Q9ULV1 537 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM129A0AVI4 362 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 G3V3Q6 166 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 TNFRSF10BO14763 440 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 HPGDSO60760 199 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 PTP4A3O75365 173 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SNAPC5O75971 98 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 DHFRP00374 187 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATF6P18850 670 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB3AP20336 220 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 GAS1P54826 345 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB14P61106 215 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 CXCL9Q07325 125 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-212ENST00000620722 RBBP4Q09028 425 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms