RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PDPRQ8NCN5 879 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TPD52L3Q96J77 140 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SORT1Q99523 831 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IFT27Q9BW83 186 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NANOGQ9H9S0 305 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 C5AR2Q9P296 337 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A0A087X0M5 115 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GX30 115 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN2O60636 221 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 H6PDO95479 791 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA6P08185 405 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LINC00614P0C842 121 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF30P17039 623 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 POU1F1P28069 291 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NMBRP28336 390 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ADRA1AP35348 466 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TGFBR2P37173 567 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PTPRNQ16849 979 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SYT16Q17RD7 645 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 HKDC1Q2TB90 917 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 KCNMB4Q86W47 210 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DHFR2Q86XF0 187 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FBXO17Q96EF6 278 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF479Q96JC4 524 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SIK2Q9H0K1 926 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OSER1Q9NX31 292 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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HCG18-244ENST00000602516 ALG5Q9Y673 324 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 V9GYQ6 96 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.31□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FAM234BA2RU67 622 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 A4D1N5 150 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DUXAA6NLW8 204 aa7.3□□□□□ -1.24
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HCG18-244ENST00000602516 MTX2O75431 263 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ANXA9O76027 345 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CXCL14O95715 111 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CHRNGP07510 517 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ACSM4P0C7M7 580 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RALBP11234 206 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TPH1P17752 444 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 FMO4P31512 558 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ARRB2P32121 409 aa7.3□□□□□ -1.24
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HCG18-244ENST00000602516 ACLYP53396 1101 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GMFBP60983 142 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IRX4P78413 519 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 SEMG2Q02383 582 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 TBCCQ15814 346 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 PCID2Q5JVF3 399 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 DHDDSQ86SQ9 333 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CPOQ8IVL8 374 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 APOL2Q9BQE5 337 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-244ENST00000602516 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.3□□□□□ -1.24
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