RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 BEST3Q8N1M1 668 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 TMEM151AQ8N4L1 468 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 TMEM52Q8NDY8 209 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 B3GNT7Q8NFL0 401 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 ELP5Q8TE02 316 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 TRPC4APQ8TEL6 797 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 C19orf60Q96EN9 201 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 ADAP2Q9NPF8 381 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 AHSPQ9NZD4 102 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 KCMF1Q9P0J7 381 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 SNX6Q9UNH7 406 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PPM1 405 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 ESPNB1AK53 854 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CDH16O75309 829 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TNNI3P19429 210 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 HSD17B3P37058 310 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CLCN2P51788 898 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 VSNL1P62760 191 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CLCQ05315 142 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 SGO1Q5FBB7 561 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 GPR180Q86V85 440 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 NUDT13Q86X67 352 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 MZB1Q8WU39 189 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CCDC126Q96EE4 140 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CDCP1Q9H5V8 836 aa25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TLDC2A0PJX2 215 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 DLX3O60479 287 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TSPAN8P19075 237 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 GNLYP22749 145 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 LGI4Q8N135 537 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CCDC63Q8NA47 563 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 WDR41Q9HAD4 459 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 GRID1Q9ULK0 1009 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 PPT2Q9UMR5 302 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.19■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 NBASA2RRP1 2371 aa25.18■■□□□ 1.62
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BRD4-208ENST00000597315 PPP2R1BP30154 601 aa25.18■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 PAGE2Q7Z2X7 111 aa25.18■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.18■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 SELENOMQ8WWX9 145 aa25.18■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 VMP1Q96GC9 406 aa25.18■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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BRD4-208ENST00000597315 TRPS1Q9UHF7 1281 aa25.18■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 GABRR3A8MPY1 467 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 FCHO1O14526 889 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 COPEO14579 308 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 DYRK3O43781 588 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 PRAMEF2O60811 474 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 SEMA3DO95025 777 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 MLYCDO95822 493 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 MYL2P10916 166 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 COX7A2P14406 83 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 RASA2Q15283 850 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 INAQ16352 499 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 CCDC153Q494R4 210 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 EMBQ6PCB8 327 aa25.17■■□□□ 1.62
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BRD4-208ENST00000597315 GRHL3Q8TE85 626 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TMEM237Q96Q45 408 aa25.17■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa25.16■■□□□ 1.62
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BRD4-208ENST00000597315 OR4F21O95013 312 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 HMOX2P30519 316 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 BSGP35613 385 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 UQCRFS1P47985 274 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 PRKAA2P54646 552 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 TNFRSF17Q02223 184 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 BIKQ13323 160 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 NR6A1Q15406 480 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 UNC50Q53HI1 259 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 BCORP1Q8N888 145 aa25.16■■□□□ 1.62
BRD4-208ENST00000597315 OR14A16Q8NHC5 309 aa25.16■■□□□ 1.62
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