RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589759.1

ATP6V0A1-223, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 3

Gene ATP6V0A1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NR6A1	Q15406	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SSX1	Q16384	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SVBP	Q8N300	66 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		Q8N402	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KAT2A	Q92830	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FCRL1	Q96LA6	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MGLL	Q99685	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		L7N2F9	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DPYSL4	O14531	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MEIS2	O14770	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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