RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CRCPO75575 148 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ESRRBO95718 433 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT6AP02538 564 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT6BP04259 564 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNA16P05015 189 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MYZAPP0CAP1 466 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CHN1P15882 459 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNI3P19429 210 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT6CP48668 564 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HTR6P50406 440 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXA1P55317 472 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD17B7P56937 341 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NAA20P61599 178 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ID2Q02363 134 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ASPHQ12797 758 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 STX4Q12846 297 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 KLRB1Q12918 225 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LCP2Q13094 533 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 RCN2Q14257 317 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NADK2Q4G0N4 442 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LIPMQ5VYY2 423 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 C18orf63Q68DL7 685 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CROCCP2Q86T23 111 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF605Q86T29 641 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 AGAP11Q8TF27 550 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMF1Q92530 271 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CNDP1Q96KN2 507 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 AGAP4Q96P64 663 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LPAR4Q99677 370 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNK13Q9HB14 408 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LYRM4Q9HD34 91 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MKS1Q9NXB0 559 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 STMN3Q9NZ72 180 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SENP1Q9P0U3 644 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF11Q9UIL8 331 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ASB4Q9Y574 426 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SPACA6W5XKT8 324 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ATMQ13315 3056 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0A6YYD5 115 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PR48 441 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PGRMC2O15173 223 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SUV39H1O43463 412 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPRSS11DO60235 418 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 DPM1O60762 260 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 F10P00742 488 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ALPPP05187 535 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINA7P05543 415 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 BPGMP07738 259 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CYC1P08574 325 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 UROSP10746 265 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NEFHP12036 1026 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R1BP30154 601 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CD97P48960 835 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ARFIP1P53367 373 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC26A5P58743 744 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGCS1Q01581 520 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MPP2Q14168 576 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CASP8Q14790 479 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 EXT1Q16394 746 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms