RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE2FQ969M7 185 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YIPF6Q96EC8 236 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C12orf66Q96MD2 445 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNC2Q96PR1 638 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCG4Q9H172 646 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RMI1Q9H9A7 625 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RASSF1Q9NS23 344 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACER3Q9NUN7 267 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF6Q9Y252 685 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRANK1O15050 2925 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1F1O43749 312 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMPRSS11DO60235 418 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC3AO75596 197 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLPXO76031 633 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RECKO95980 971 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RHCEP18577 417 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP2K4P45985 399 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALDH9A1P49189 494 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB28P51157 221 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEKQ02763 1124 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MLC1Q15049 377 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR52J3Q8NH60 311 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FNDC8Q8TC99 324 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RHNO1Q9BSD3 238 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RLIMQ9NVW2 624 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB23Q9ULC3 237 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBC2A0A5B9 178 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRR19A6NJB7 356 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 J3KTA2 159 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNJ13O60928 360 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNC4Q03721 635 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLCA4Q14CN2 919 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 P3H2Q8IVL5 708 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMYD1Q8NB12 490 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTLQ8NG68 377 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNASE1L2Q92874 299 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCND3Q9UK17 655 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0A6YYD5 115 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PKLRP30613 574 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PARP8Q8N3A8 854 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABHD8Q96I13 439 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KXD1Q9BQD3 176 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NECTIN3Q9NQS3 549 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AXIN1O15169 862 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC22A1O15245 554 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GADD45GO95257 159 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FADS2O95864 444 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VIPP01282 170 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms