RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NUS1Q96E22 293 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF69Q9UC07 566 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DOCK2Q92608 1830 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 BCORQ6W2J9 1755 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MEIOCA2RUB1 952 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MCIDASD6RGH6 385 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LYRM1O43325 122 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KDM4BO94953 1096 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NFATC1O95644 943 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CXCL14O95715 111 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 IL3P08700 152 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HNF1BP35680 557 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OXA1LQ15070 435 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SEC23BQ15437 767 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 C4orf46Q504U0 113 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 IL17CQ9P0M4 197 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FBXO10Q9UK96 956 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LRRTM2O43300 516 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GNRH1P01148 92 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ACTC1P68032 377 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ACTA1P68133 377 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PON3Q15166 354 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MANEALQ5VSG8 457 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PIGKQ92643 395 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 FATE1Q969F0 183 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SCRN2Q96FV2 425 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TXNDC15Q96J42 360 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF583Q96ND8 569 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR4K3Q96R72 315 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR51E2Q9H255 320 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OSER1Q9NX31 292 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NLKQ9UBE8 527 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LIPT1Q9Y234 373 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MED31Q9Y3C7 131 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0G2JPF8 293 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MROH6A6NGR9 719 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 J3QLW9 94 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 M0QZQ0 153 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PCDH17O14917 1159 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 B3GALT2O43825 422 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF19P17023 458 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DPP6P42658 865 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CCL23P55773 120 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NTRK2Q16620 822 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RGMBQ6NW40 437 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR2T33Q8NG76 320 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF563Q8TA94 476 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 INPP5KQ9BT40 448 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 BRF2Q9HAW0 419 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GVI7 797 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 COQ9O75208 318 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RP2O75695 350 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OAZ2O95190 189 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CRYZL1O95825 349 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CH25HO95992 272 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LAMP1P11279 417 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 EDNRAP25101 427 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CASP3P42574 277 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MTNR1AP48039 350 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DNASE1L1P49184 302 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DEFA5Q01523 94 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms