RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PMP22Q01453 160 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ELP6Q0PNE2 266 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 HSPA14Q0VDF9 509 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CNTN1Q12860 1018 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 DRP2Q13474 957 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 OR1C1Q15619 314 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 MPPE1Q53F39 396 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 IL23RQ5VWK5 629 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZNF790Q6PG37 636 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TMEM64Q6YI46 380 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 LCA5Q86VQ0 697 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 C17orf64Q86WR6 236 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 OR6M1Q8NGM8 313 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 FBXO30Q8TB52 745 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 AGPAT1Q99943 283 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TSPY26PQ9H489 355 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SIX2Q9NPC8 291 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 EXTL2Q9UBQ6 330 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PTPRUQ92729 1446 aa4.6□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 A0A087WZ39 114 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SYNGR4O95473 234 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SEC24AO95486 1093 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZMYM6O95789 1325 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CAVIN2O95810 425 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CGAP01215 116 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 KRT8P05787 483 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 UMODP07911 640 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 FAM157CP0CG43 387 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PRKAR1AP10644 381 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GNSP15586 552 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 AADACP22760 399 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SLC6A8P48029 635 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ELMOD1Q8N336 334 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 BCORP1Q8N888 145 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TCEANCQ8N8B7 351 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TM9SF4Q92544 642 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 P3H4Q92791 437 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 NCLNQ969V3 563 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 RAB7BQ96AH8 199 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GIMAP5Q96F15 307 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 GPA33Q99795 319 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 FICDQ9BVA6 458 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 POMT2Q9UKY4 750 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 OR1A2Q9Y585 309 aa4.59□□□□□ -1.67
USP15-218ENST00000552346 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 CUX2O14529 1486 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 CHADO15335 359 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 PROS1P07225 676 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 TSPY4P0CV99 314 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 TSPY10P0CW01 314 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 TPBGLP0DKB5 382 aa4.58□□□□□ -1.68
USP15-218ENST00000552346 AMD1P17707 334 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms