RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PLK4O00444 970 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IL2RAP01589 272 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 THBS2P35442 1172 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GABREP78334 506 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TERF2Q15554 542 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KDELC1Q6UW63 502 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CHST14Q8NCH0 376 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A18Q96N87 628 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TCHHQ07283 1943 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GX78 115 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RAD1O60671 282 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BCL10O95999 233 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IFNA6P05013 189 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINA6P08185 405 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PNMTP11086 282 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PRKCHP24723 683 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A9P48067 706 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CYB561P49447 251 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SMCO1Q147U7 214 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF382Q96SR6 550 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IFT27Q9BW83 186 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR1A2Q9Y585 309 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CLOCKO15516 846 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PRKAR1AP10644 381 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ATF6P18850 670 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GADD45AP24522 165 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CCL11P51671 97 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 COX10Q12887 443 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GK3PQ14409 553 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GPR68Q15743 365 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR2A2Q6IF42 318 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 S100A7AQ86SG5 101 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PLLPQ9Y342 182 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LY75O60449 1722 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MYO9BQ13459 2157 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 VHLP40337 213 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 VBP1P61758 197 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FCRL6Q6DN72 434 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf26Q96N11 449 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PKP4Q99569 1192 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GABRR3A8MPY1 467 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LMO7DNF2Z398 122 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PGRMC2O15173 223 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 VILLO15195 856 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SEC14L5O43304 696 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ATG12O94817 140 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GPIP06744 558 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CHRNA4P43681 627 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SNAPC1Q16533 368 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CYP1B1Q16678 543 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf22Q49AR2 442 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM74Q86UV6 250 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZBTB9Q96C00 473 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GPR22Q99680 433 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF559Q9BR84 538 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RREB1Q92766 1687 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TARM1B6A8C7 271 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TNFRSF11BO00300 401 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 TBPL1P62380 186 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-209ENST00000550857 MERTKQ12866 999 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms