RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CLMPQ9H6B4 373 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 LHX9Q9NQ69 397 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 STARD5Q9NSY2 213 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NDE1Q9NXR1 346 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PISDQ9UG56 409 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PADI1Q9ULC6 663 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FRYLO94915 3013 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SGK494L7N484 410 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ANKRD28O15084 1053 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ANGPT2O15123 496 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TMPRSS11DO60235 418 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CTNSO60931 367 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RDH16O75452 317 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 IGHEP01854 428 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 IL3P08700 152 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 IFI6P09912 130 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CCL4P13236 92 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 COX7A2P14406 83 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PIK3R1P27986 724 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 S100A3P33764 101 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RORAP35398 523 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KIR3DL1P43629 444 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MAPK10P53779 464 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KLF10Q13118 480 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PDE7AQ13946 482 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RUNX2Q13950 521 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SERTAD2Q14140 314 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RCAN2Q14206 197 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PTGR1Q14914 329 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 AGKQ53H12 422 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TMEM198Q66K66 360 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PDSS2Q86YH6 399 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CA13Q8N1Q1 262 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ESX1Q8N693 406 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.8□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 COQ8BQ96D53 544 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ERP27Q96DN0 273 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 GBP5Q96PP8 586 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SATB2Q9UPW6 733 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.8□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 A0A0G2JN53 185 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PP18 115 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PR48 441 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CCDC154A6NI56 674 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 STMND1H3BQB6 276 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CYR61O00622 381 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DYRK3O43781 588 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KIAA0754O94854 1291 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SOX30O94993 753 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TNFSF15O95150 251 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 GPR75O95800 540 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 STATHP02808 62 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PGRP06401 933 aa8.79□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FHP07954 510 aa8.79□□□□□ -1
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