RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532581.5

GRAMD1B-208, Transcript of GRAM domain containing 1B, human

TSL 2

Gene GRAMD1B, Length 2,615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RHCG	Q9UBD6	479 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TLR4	O00206	839 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CTDSP2	O14595	271 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLITRK5	O94991	958 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GJA1	P17302	382 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	UQCRC2	P22695	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DOC2B	Q14184	412 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HHATL	Q9HCP6	504 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ENTPD6	O75354	484 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CCNK	O75909	580 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LRG1	P02750	347 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KLK1	P06870	262 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OSM	P13725	252 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	POU1F1	P28069	291 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ARSI	Q5FYB1	569 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TRIM69	Q86WT6	500 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PDXP	Q96GD0	296 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NLN	Q9BYT8	704 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	UCK2	Q9BZX2	261 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ICK	Q9UPZ9	632 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FFAR1	O14842	300 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RGS13	O14921	159 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	IL3	P08700	152 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TNFSF8	P32971	234 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	BMPR1A	P36894	532 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NR4A2	P43354	598 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DUSP7	Q16829	419 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPATC1	Q76KD6	591 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	AP2M1	Q96CW1	435 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR2A14	Q96R47	310 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ASPN	Q9BXN1	380 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NDUFB5	O43674	189 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRT8	P05787	483 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LIM2	P55344	173 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR2B6	P58173	313 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	IFITM2	Q01629	132 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ILK	Q13418	452 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	UBE2E3	Q969T4	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM80	Q96HE8	168 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MND1	Q9BWT6	205 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ASAH2	Q9NR71	780 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		12.48	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms