RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309		A0A0J9YWU9	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PRDM1	O75626	825 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CALCA	P01258	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	LYN	P07948	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	MMP10	P09238	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	B4GALT1	P15291	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	FCGR2C	P31995	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	FHIT	P49789	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	RBBP4	Q09028	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	MEF2D	Q14814	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ASB14	A6NK59	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	VEGFD	O43915	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SNAP91	O60641	907 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GMNN	O75496	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CGA	P01215	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	UGT1A6	P19224	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CBX3	Q13185	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF146	Q15072	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SLC28A1	O00337	649 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	OGT	O15294	1046 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SERPINB2	P05120	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GPX3	P22352	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GLRA1	P23415	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	OR1C1	Q15619	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	VGLL1	Q99990	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309		E9PQ18	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	NT5C2	P49902	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASP4-208	ENST00000530309	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms