RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CLDN4	O14493	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MAN1A2	O60476	641 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	WISP2	O76076	250 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ABHD2	P08910	425 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MAOA	P21397	527 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC6A12	P48065	614 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	OLR1	P78380	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	HYAL2	Q12891	473 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MYBPH	Q13203	477 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NINJ1	Q92982	152 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	VMP1	Q96GC9	406 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120		E7ESA3	106 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	B3GALT2	O43825	422 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CLEC3A	O75596	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	WDR47	O94967	919 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DRD4	P21917	467 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ITGA8	P53708	1063 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SEC24C	P53992	1094 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB8A	P61006	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	POU4F1	Q01851	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TGM3	Q08188	693 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NRGN	Q92686	78 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CDKL2	Q92772	493 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CDC7	O00311	574 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MYO1D	O94832	1006 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FOSL1	P15407	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CHN1	P15882	459 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	GGT5	P36269	586 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	HNF4A	P41235	474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SSR4	P51571	173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB38	P57729	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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