RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN14O95500 239 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TUBB4AP04350 444 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PCNAP12004 261 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CASQ1P31415 396 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CASP2P42575 452 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEA4P43358 317 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 GPR85P60893 370 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 DLG1Q12959 904 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 NAB1Q13506 487 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MED27Q6P2C8 311 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 HSDL2Q6YN16 418 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 FGD2Q7Z6J4 655 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ISCA2Q86U28 154 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 DOLPP1Q86YN1 238 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 FBF1Q8TES7 1133 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ASB15Q8WXK1 588 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 HPF1Q9NWY4 346 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 OPTCQ9UBM4 332 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 E9PLN8 166 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 UBXN8O00124 270 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 HS6ST1O60243 411 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 OR2J2O76002 312 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CRABP2P29373 138 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SERPINB1P30740 379 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SERTAD2Q14140 314 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MORN4Q8NDC4 146 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 VKORC1Q9BQB6 163 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MYOTQ9UBF9 498 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.93■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1B0GTH9 108 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 K7EPI3 171 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 LDB3O75112 727 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PTGS2P35354 604 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SSR2P43308 183 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 GTF3C1Q12789 2109 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CDSNQ15517 529 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 LAS2Q8IYD9 372 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 RASL10BQ96S79 203 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 OR8D2Q9GZM6 311 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.92■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf105B2RV13 164 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SCELO95171 688 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TGFB1P01137 390 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TPOP07202 933 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TNNI3P19429 210 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CHSY3Q70JA7 882 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CD163Q86VB7 1156 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 DMRTA2Q96SC8 542 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PPT2Q9UMR5 302 aa22.91■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SYCE1LA8MT33 242 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 WWP2O00308 870 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SH3BGRLO75368 114 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 OR6B1O95007 311 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CPN2P22792 545 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SOX3P41225 446 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 HK2P52789 917 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 OR7G3Q8NG95 312 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SLC2A12Q8TD20 617 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 NXNL1Q96CM4 212 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 DEPPQ9NTK1 212 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ACOT9Q9Y305 439 aa22.9■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms