RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCG2P13521 617 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EVCP57679 992 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBP5P82980 135 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNTN1Q12860 1018 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAPK11Q15759 364 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ECSCRQ19T08 205 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHL10Q6JEL2 608 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC27A4Q6P1M0 643 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADCK2Q7Z695 626 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM219AQ8IW50 185 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC170Q8IYT3 715 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VPS33AQ96AX1 596 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBC1D31Q96DN5 1066 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKRD27Q96NW4 1050 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NMUR1Q9HB89 426 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYOZ2Q9NPC6 264 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CUTCQ9NTM9 273 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MGAT4AQ9UM21 535 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPRASP1Q5JY77 1395 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBP2O00757 339 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HDAC3O15379 428 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MLNRO43193 412 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PGLSO95336 258 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 QDPRP09417 244 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFNAR1P17181 557 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP5DP30049 168 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC1A6P48664 564 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NAGLUP54802 743 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BFSP1Q12934 665 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCL14Q16627 93 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 XKR4Q5GH76 650 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRBOX4Q5JUW0 171 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MARC1Q5VT66 337 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLPP4Q5VZY2 271 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC186Q7Z3E2 898 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBC1D10CQ8IV04 446 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CROCCP3Q8IVE0 287 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TIGD4Q8IY51 512 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NUP93Q8N1F7 819 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM99Q8N816 258 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IQUBQ8NA54 791 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BEST4Q8NFU0 473 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD99L2Q8TCZ2 262 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC39A8Q9C0K1 460 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMCC3Q9ULS5 477 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CPQQ9Y646 472 aa2.27□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A0B4J203 849 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCGR3BO75015 233 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HMMRO75330 724 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLU7O95391 586 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MT-ND3P03897 115 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SP9P0CG40 484 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EEF2P13639 858 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP6V1E1P36543 226 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC1A3P43003 542 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPP38P78345 283 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NAAAQ02083 359 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBXN1Q04323 297 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBBP4Q09028 425 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C17orf67Q0P5P2 114 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AP1B1Q10567 949 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TFCP2Q12800 502 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CAMK2DQ13557 499 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITPK1Q13572 414 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDO1Q16878 200 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF674Q2M3X9 581 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARMCX5Q6P1M9 558 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TATDN1Q6P1N9 297 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.26□□□□□ -2.05
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms