RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 HGH1Q9BTY7 390 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 OGFRQ9NZT2 677 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 NFS1Q9Y697 457 aa7.16□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 AKAP13Q12802 2813 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CACNA1AO00555 2505 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 A0A0G2JNG1 304 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 OR5K4A6NMS3 321 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 D6RAR5 112 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 E7ESA3 106 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 AGPSO00116 658 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 WDR47O94967 919 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 FTH1P02794 183 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TUBB4AP04350 444 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TPBGLP0DKB5 382 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM225BP0DP42 221 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CREB1P16220 341 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 AMD1P17707 334 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ITIH1P19827 911 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 MAGEA4P43358 317 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 BDKRB1P46663 353 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CDKN2DP55273 166 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ILKQ13418 452 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KIR2DS5Q14953 304 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KYNUQ16719 465 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TEX35Q5T0J7 233 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 STEAP4Q687X5 459 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 IRGCQ6NXR0 463 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PCSK4Q6UW60 755 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 GPATCH11Q8N954 259 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM159Q96B96 161 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 IL17FQ96PD4 163 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 TGM7Q96PF1 710 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 GPR21Q99679 349 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 GNPTGQ9UJJ9 305 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ACSL5Q9ULC5 683 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 NFU1Q9UMS0 254 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SATB2Q9UPW6 733 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ASF1AQ9Y294 204 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 OR6C74A6NCV1 312 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 E5RI56 91 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 AP4M1O00189 453 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 BTN3A3O00478 584 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 KCNJ13O60928 360 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 CPNE6O95741 557 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 TTC4O95801 387 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 PROS1P07225 676 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 CCL4P13236 92 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 SLC2A4P14672 509 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 MCM3P25205 808 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 ACADLP28330 430 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 ETV5P41161 510 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 TUBB2AQ13885 445 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 ZBTB2Q8N680 514 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.14□□□□□ -1.27
UBE2B-204ENST00000504431 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms