RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	LRFN1	Q9P244	771 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SCN2A	Q99250	2005 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2W5	A6NFC9	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OR10H2	O60403	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH16	O75309	829 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA3D	O95025	777 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	F10	P00742	488 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CELA2A	P08217	269 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL2	P10916	166 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CD22	P20273	847 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	HMOX2	P30519	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	HERVK_113	P63132	956 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RASA2	Q15283	850 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1C1	Q15619	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	HSDL2	Q6YN16	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MORN4	Q8NDC4	146 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ELP5	Q8TE02	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GRHL3	Q8TE85	626 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMF1	Q92530	271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PPT2	Q9UMR5	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB1	Q9Y576	335 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM23	A6NLE4	172 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf105	B2RV13	164 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	COPE	O14579	308 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SCEL	O95171	688 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DDAH2	O95865	285 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	NR2F6	P10588	404 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PYGB	P11216	843 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	EPOR	P19235	508 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3R1	P27986	724 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SSR4	P51571	173 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF17	Q02223	184 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CLC	Q05315	142 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB15	Q8WXK1	588 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	C19orf60	Q96EN9	201 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	BRF2	Q9HAW0	419 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PCTP	Q9UKL6	214 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GUH1	482 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MT66	165 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MVJ9	347 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8R	I6L899	631 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CYR61	O00622	381 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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