RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496038.1

BCAN-208, Transcript of brevican, humanhuman

TSL 2

Gene BCAN, Length 1,871 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAN-208ENST00000496038 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 C5orf42Q9H799 3197 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PRR19A6NJB7 356 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 KMOO15229 486 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MAN1A2O60476 641 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PCCBP05166 539 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 NR4A1P22736 598 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 GJA4P35212 333 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MAPK12P53778 367 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MLC1Q15049 377 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 QRFPRQ96P65 431 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CDH23Q9H251 3354 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 J3KTA2 159 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MAGEB3O15480 346 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 B4GALT2O60909 372 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 VIPP01282 170 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 SOAT1P35610 550 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 OPRL1P41146 370 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 KCNC4Q03721 635 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MAPK11Q15759 364 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DUSP6Q16828 381 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 VITQ6UXI7 678 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 AHSA2Q719I0 299 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TRBC2A0A5B9 178 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CLCA1A8K7I4 914 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PDPK1O15530 556 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PFDN1O60925 122 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 SULT1C4O75897 302 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TFPTP0C1Z6 253 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PSMB9P28065 219 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PBX2P40425 430 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TMED1Q13445 227 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 GPM6BQ13491 265 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 RUNX3Q13761 415 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DUSP7Q16829 419 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 C2orf27AQ580R0 203 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 NUDT13Q86X67 352 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 P3H2Q8IVL5 708 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 COPS4Q9BT78 406 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ABCG4Q9H172 646 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.62□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CLDN25C9JDP6 229 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 J3QRK9 145 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PCDH17O14917 1159 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TMPRSS11DO60235 418 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 KAT7O95251 611 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 LCKP06239 509 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CDK1P06493 297 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 FUT4P22083 530 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 PSMB5P28074 263 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 IDUAP35475 653 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 GRK3P35626 688 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 CSNK1G2P78368 415 aa14.61□□□□□ -0.07
BCAN-208ENST00000496038 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms