RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.06□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 A0A0G2JN53 185 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 OR2W5A6NFC9 320 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ARGFXA6NJG6 315 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SAP18O00422 153 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PRMT3O60678 531 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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SRPRB-205ENST00000494297 COX6A1P12074 109 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ACPPP15309 386 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PRPH2P23942 346 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CERS1P27544 350 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SSR2P43308 183 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 GSTM5P46439 218 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SERPINB4P48594 390 aa5.05□□□□□ -1.6
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SRPRB-205ENST00000494297 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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SRPRB-205ENST00000494297 BTG2P78543 158 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 Q0VFX4 171 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 KCNAB2Q13303 367 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SERTAD2Q14140 314 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 KIAA0040Q15053 153 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PCOLCEQ15113 449 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 NR6A1Q15406 480 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 NSDHLQ15738 373 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 UGT3A2Q3SY77 523 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SGO1Q5FBB7 561 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 KANK2Q63ZY3 851 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PAGE2Q7Z2X7 111 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CUZD1Q86UP6 607 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 NUDT13Q86X67 352 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 HPS6Q86YV9 775 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 M1APQ8TC57 530 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TANKQ92844 425 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ARL8AQ96BM9 186 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 C8orf44Q96CB5 159 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 KCNA7Q96RP8 456 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CCT7Q99832 543 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 MECRQ9BV79 373 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 C5AR2Q9P296 337 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 PHF11Q9UIL8 331 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TIMM22Q9Y584 194 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 SPACA6W5XKT8 324 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 LAMA5O15230 3695 aa5.05□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.04□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1W2PR48 441 aa5.04□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM120BA0PK00 339 aa5.04□□□□□ -1.6
SRPRB-205ENST00000494297 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.04□□□□□ -1.6
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