RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ASPDHA6ND91 283 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRTM2O43300 516 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ZFAND5O76080 213 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF224P0DH78 156 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR143P51810 404 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CTDSP1-211ENST00000492545 STX4Q12846 297 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 KRTCAP3Q53RY4 240 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM52Q8NDY8 209 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM125Q96AQ2 219 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 KLHL1Q9NR64 748 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 STX16O14662 325 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC25A12O75746 678 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTDSP1-211ENST00000492545 MST1P26927 711 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SSR2P43308 183 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTDSP1-211ENST00000492545 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTDSP1-211ENST00000492545 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 RELTQ969Z4 430 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CSF3RQ99062 836 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 OR51B5Q9H339 312 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC5CO95185 931 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ABHD2P08910 425 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 RAP1GDS1P52306 607 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 CUL3Q13618 768 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 NCLNQ969V3 563 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF11Q9UIL8 331 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 PPT2Q9UMR5 302 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.06■■□□□ 1.12
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CTDSP1-211ENST00000492545 CPN2P22792 545 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP2R1BP30154 601 aa22.06■■□□□ 1.12
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CTDSP1-211ENST00000492545 KCNK10P57789 538 aa22.06■■□□□ 1.12
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CTDSP1-211ENST00000492545 SLAMF1Q13291 335 aa22.06■■□□□ 1.12
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CTDSP1-211ENST00000492545 MAPKAPK3Q16644 382 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM156Q8N614 296 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TANKQ92844 425 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 SCYL1Q96KG9 808 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
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CTDSP1-211ENST00000492545 GPR180Q86V85 440 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 OR8K3Q8NH51 312 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 MTBPQ96DY7 904 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 NTMT1Q9BV86 223 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 NFU1Q9UMS0 254 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ITGA10O75578 1167 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP1-211ENST00000492545 COX7A2P14406 83 aa22.04■■□□□ 1.12
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