RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC61Q9BV99 259 aa16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 RHBGQ9H310 441 aa16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 A0A0C4DFX4 3053 aa16.49■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 OR6C74A6NCV1 312 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 GABRR3A8MPY1 467 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 G3V2T6 193 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 HPRP00739 348 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 LAMP1P11279 417 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ACPPP15309 386 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 BCL6P41182 706 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TTC23Q5W5X9 447 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SPARTQ8N0X7 666 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 METTL4Q8N3J2 472 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 MS4A8Q9BY19 250 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TOR3AQ9H497 397 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SERHLQ9NQF3 203 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 B4DGG1 531 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TLR4O00206 839 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 PLPP1O14494 284 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 KDM1AO60341 852 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 C1QCP02747 245 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 EPS8Q12929 822 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FAM9CQ8IZT9 166 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 MMP21Q8N119 569 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 GSAPA4D1B5 854 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 GSTA4O15217 222 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CMPK1P30085 196 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 KIR3DL1P43629 444 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CYP4F3Q08477 520 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SPACA7Q96KW9 195 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 BLKP51451 505 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 WNT3P56703 355 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TAS2R50P59544 299 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SPCS2Q15005 226 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CLECL1Q8IZS7 167 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 OR2T12Q8NG77 320 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FIG4Q92562 907 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF583Q96ND8 569 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC115Q96NT0 180 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 KLHL31Q9H511 634 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.47■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 HTR1AP08908 422 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 OPRL1P41146 370 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 C2orf80Q0P641 193 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 AQP6Q13520 282 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 AMER3Q8N944 861 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 LMX1AQ8TE12 382 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 AICDAQ9GZX7 198 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 TRBC2A0A5B9 178 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 PRAMEF10O60809 474 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SDC3O75056 442 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CST1P01037 141 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CSF2P04141 144 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 NR4A1P22736 598 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 GRK3P35626 688 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms