RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LAS2	Q8IYD9	372 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CA13	Q8N1Q1	262 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RELT	Q969Z4	430 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	APOPT1	Q96IL0	206 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	QRFPR	Q96P65	431 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SERINC2	Q96SA4	455 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL31	Q9H511	634 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MKS1	Q9NXB0	559 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN2A	Q99250	2005 aa		16.19	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MUI8	341 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GALT2	O43825	422 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	B4GALT2	O60909	372 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT7L	O94864	414 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OTC	P00480	354 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PCNA	P12004	261 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CPA3	P15088	417 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IMPDH1	P20839	514 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MTTP	P55157	894 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB38	P57729	211 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	BTN3A2	P78410	334 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBA3C	Q13748	450 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MDS2	Q8NDY4	140 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TSLP	Q969D9	159 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCMH1	Q96GD3	660 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNC2	Q96PR1	638 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TAAR6	Q96RI8	345 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPK	Q9BS16	269 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	AICDA	Q9GZX7	198 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LYRM4	Q9HD34	91 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PCTP	Q9UKL6	214 aa		16.18	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DLX3	O60479	287 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PLIN3	O60664	434 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB6	O75190	326 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SCEL	O95171	688 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PROC	P04070	461 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CD46	P15529	392 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CD96	P40200	585 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAA2	P54646	552 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF766	Q5HY98	468 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CHSY3	Q70JA7	882 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	BANP	Q8N9N5	519 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NTMT1	Q9BV86	223 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DAPP1	Q9UN19	280 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PLLP	Q9Y342	182 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB1	Q9Y576	335 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA1D	Q01668	2161 aa		16.17	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPDH	A6ND91	283 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2W5	A6NFC9	320 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BQF6	201 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF4	O60810	478 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	EPOR	P19235	508 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3CB	P42338	1070 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNX2	Q13950	521 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MTFR2	Q6P444	385 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		16.16	■□□□□ 0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms