RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 NOTCH2Q04721 2471 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GTH9 108 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CYR61O00622 381 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 ZNHIT1O43257 154 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 DYRK3O43781 588 aa18.75■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 C16orf52Q8NHV5 167 aa18.75■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 C17orf105B2RV13 164 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TGFBR3LH3BV60 316 aa18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 ADGRE2Q9UHX3 823 aa18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 CELSR2Q9HCU4 2923 aa18.74■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 K7EPI3 171 aa18.73■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 KERAO60938 352 aa18.73■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 TGFB1P01137 390 aa18.73■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 ACOT4Q8N9L9 421 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 FBF1Q8TES7 1133 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 ACOT9Q9Y305 439 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CREBBPQ92793 2442 aa18.73■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 SH3BGRLO75368 114 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 FAM155BO75949 473 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 PDE9AO76083 593 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 RTL4Q6ZR62 310 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 GK5Q6ZS86 529 aa18.72■□□□□ 0.59
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ACTB-212ENST00000484841 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A16Q86VW1 577 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 LAS2Q8IYD9 372 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 OR8K3Q8NH51 312 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 DGAT2Q96PD7 388 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 RASL10BQ96S79 203 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 DEFB127Q9H1M4 99 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CLDN16Q9Y5I7 305 aa18.72■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 ITPR2Q14571 2701 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 A0A087X1B8 175 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 RTCAO00442 366 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 OR6B1O95007 311 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.71■□□□□ 0.59
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