RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CLMPQ9H6B4 373 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ARL15Q9NXU5 204 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RAB23Q9ULC3 237 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MANBAO00462 879 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 F11P03951 625 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ALAS2P22557 587 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2L1Q07817 233 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 IL17CQ9P0M4 197 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NUP50Q9UKX7 468 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A5O76082 557 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ITPKAP23677 461 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GABRR2P28476 465 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA6Q15825 494 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GPR156Q8NFN8 814 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ST8SIA2Q92186 375 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CREBZFQ9NS37 354 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LHX3Q9UBR4 397 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.52■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ENTPD6O75354 484 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PDYNP01213 254 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 C1QBP02746 253 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 IL32P24001 234 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ARSKQ6UWY0 536 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF21Q96ID5 467 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CAPNS2Q96L46 248 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PKP4Q99569 1192 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PCDH17O14917 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LYRM1O43325 122 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TPST2O60704 377 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TPPPO94811 219 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH1A1P00352 501 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 AVPR1BP47901 424 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NCF4Q15080 339 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CASP12Q6UXS9 341 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CEP76Q8TAP6 659 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FATE1Q969F0 183 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TM9SF2Q99805 663 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM245Q9H330 911 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1HQ9UI12 483 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NCR1O76036 304 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ARSBP15848 533 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 SOAT1P35610 550 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 HNF1BP35680 557 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT1P36639 197 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PTGER3P43115 390 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0040Q15053 153 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 P2RY14Q15391 338 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 APIPQ96GX9 242 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G10O15496 165 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK5O95279 499 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CACNG1Q06432 222 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 FCN2Q15485 313 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GPR68Q15743 365 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 CNIH2Q6PI25 160 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PDZD3Q86UT5 571 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 BEST4Q8NFU0 473 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ9Q92806 393 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 PLD4Q96BZ4 506 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms