RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	AIFM1	O95831	613 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	NPPA	P01160	153 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PTPN6	P29350	595 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PDX1	P52945	283 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ITGA1	P56199	1179 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PSME3	P61289	254 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	E2F1	Q01094	437 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ACY1	Q03154	408 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ILK	Q13418	452 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	NFYC	Q13952	458 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CYR61	O00622	381 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CHST10	O43529	356 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	RDH16	O75452	317 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CDKN2C	P42773	168 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRPC1	P48995	793 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ITCH	Q96J02	903 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCDC115	Q96NT0	180 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	C5AR2	Q9P296	337 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PHF11	Q9UIL8	331 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439		A0A096LPI6	279 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	C1orf226	A1L170	272 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	AGRP	O00253	132 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	CPN2	P22792	545 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC6A2	P23975	617 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	PGM1	P36871	562 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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