RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	FMO2	Q99518	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PFAS	O15067	1338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		A0A1B0GUV1	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		F8VVB4	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		F8VWA3	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRAF2	O60831	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RAD51D	O75771	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PALM	O75781	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CA4	P22748	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	EPS15	P42566	896 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC1A4	P43007	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RWDD2B	P57060	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	HERV-K104	P61576	105 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RCN2	Q14257	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IL17A	Q16552	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MED30	Q96HR3	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KRT12	Q99456	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CARD9	Q9H257	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TLE6	Q9H808	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UBE4B	O95155	1302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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