RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	PEX1	O43933	1283 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TPST1	O60507	370 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	CREG1	O75629	220 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNK5	O95279	499 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT75	O95678	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	RET	P07949	1114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	NR2F6	P10588	404 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	FCGR1A	P12314	374 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	IL1RN	P18510	177 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	UQCRC2	P22695	453 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	BNIP3	Q12983	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	FADD	Q13158	208 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SHB	Q15464	509 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	RGN	Q15493	299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	PLK5	Q496M5	336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	C18orf63	Q68DL7	685 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	PTOV1	Q86YD1	416 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO30	Q8TB52	745 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM10	Q96HG1	83 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDLBP-231	ENST00000467435	TECTA	O75443	2155 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PROM1	O43490	865 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINA1	P01009	418 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NUDT7	P0C024	238 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ACADS	P16219	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ALOX12	P18054	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CPN2	P22792	545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FAS	P25445	335 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GPC1	P35052	558 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PCGF2	P35227	344 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CRAT	P43155	626 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RXRG	P48443	463 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MVD	P53602	400 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GFER	P55789	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MLC1	Q15049	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	COX20	Q5RI15	118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF130	Q86XS8	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	PIGK	Q92643	395 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDLBP-231	ENST00000467435	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.64	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms