RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	CYC1	P08574	325 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	MYZAP	P0CAP1	466 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ICAM2	P13598	275 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CREB1	P16220	341 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TNNI3	P19429	210 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PPP2R1B	P30154	601 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	BTK	Q06187	659 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF33B	Q06732	778 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ASPH	Q12797	758 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CUL3	Q13618	768 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PCLAF	Q15004	111 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	EXT1	Q16394	746 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	LIPM	Q5VYY2	423 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR180	Q86V85	440 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	NUDT13	Q86X67	352 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TM9SF4	Q92544	642 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	MECR	Q9BV79	373 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	LYRM4	Q9HD34	91 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	OXSM	Q9NWU1	459 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	AHSP	Q9NZD4	102 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PHF11	Q9UIL8	331 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		9.02	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TTLL8	A6PVC2	850 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CYR61	O00622	381 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	LDB3	O75112	727 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ULK1	O75385	1050 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	MYO1D	O94832	1006 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ESRRB	O95718	433 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	KLK1	P06870	262 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CHN1	P15882	459 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ALDH3A1	P30838	453 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	BSG	P35613	385 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	HTR6	P50406	440 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	HSD17B7	P56937	341 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC26A5	P58743	744 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	TAS2R50	P59544	299 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	DNAJB13	P59910	316 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	AP2B1	P63010	937 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ARG2	P78540	354 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	IMPG1	Q17R60	797 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	C18orf63	Q68DL7	685 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	AGAP11	Q8TF27	550 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	WDR41	Q9HAD4	459 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	MKS1	Q9NXB0	559 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	SENP1	Q9P0U3	644 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	C5AR2	Q9P296	337 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		9.01	□□□□□ -0.97
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF225	Q9UK10	706 aa		9.01	□□□□□ -0.97

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