RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 RTL6Q6ICC9 239 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 SBSNQ6UWP8 590 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 KRT78Q8N1N4 520 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TTLQ8NG68 377 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CERS2Q96G23 380 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 SMIM10Q96HG1 83 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF358Q9NW07 568 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 EDARQ9UNE0 448 aa9.54□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 FAM221AA4D161 298 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CDC7O00311 574 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TTC4O95801 387 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 IGHG3P01860 377 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CCL3P10147 92 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 BMP5P22003 454 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CDC25BP30305 580 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 LIM2P55344 173 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 KCNJ2P63252 427 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ID2Q02363 134 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 RCN2Q14257 317 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF460Q14592 562 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 SLC10A1Q14973 349 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 OPN5Q6U736 354 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 LIX1Q8N485 282 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC46Q96FV0 321 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 MS4A14Q96JA4 679 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 SERINC2Q96SA4 455 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 VWA7Q9Y334 891 aa9.53□□□□□ -0.88
DDX39B-211ENST00000449757 DOCK7Q96N67 2140 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 A6NNC1 897 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LDB3O75112 727 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 LRATO95237 230 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 COX7A2P14406 83 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GABRA1P14867 456 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GNAZP19086 355 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TACR1P25103 407 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PIGAP37287 484 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 GDF5P43026 501 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TRPC1P48995 793 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MTTPP55157 894 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RNF4P78317 190 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 TGM3Q08188 693 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CDC20BQ86Y33 519 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SNX31Q8N9S9 440 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 MORN4Q8NDC4 146 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 FAM13CQ8NE31 585 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OR2L5Q8NG80 312 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SGCZQ96LD1 299 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
DDX39B-211ENST00000449757 RASSF1Q9NS23 344 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms