RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CDH13P55290 713 aa20.23■□□□□ 0.83
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLAMF1Q13291 335 aa20.23■□□□□ 0.83
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.2■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.2■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A0A6YYD5 115 aa20.19■□□□□ 0.82
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GABRR3A8MPY1 467 aa20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CDK2AP1O14519 115 aa20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COPEO14579 308 aa20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR4F21O95013 312 aa20.19■□□□□ 0.82
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NUDT17P0C025 328 aa20.19■□□□□ 0.82
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UQCRFS1P47985 274 aa20.19■□□□□ 0.82
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