RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 IGFBP7Q16270 282 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 SGO1Q5FBB7 561 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 BANPQ8N9N5 519 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 RDH11Q8TC12 318 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 HAS2Q92819 552 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 MIB2Q96AX9 1013 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 NPAS2Q99743 824 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLAAQ9Y263 795 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ASB4Q9Y574 426 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 BLACEA4D250 179 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PROM1O43490 865 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 WISP1O95388 367 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PDYNP01213 254 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 TUBBP07437 444 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 CPN2P22792 545 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 NAGLUP54802 743 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 LCP2Q13094 533 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 TERF2Q15554 542 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 C18orf63Q68DL7 685 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 GPR180Q86V85 440 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 RNF32Q9H0A6 362 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 KCNK13Q9HB14 408 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 STMN3Q9NZ72 180 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 SNX6Q9UNH7 406 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 SPACA6W5XKT8 324 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 MANBAO00462 879 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAN1A2O60476 641 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 LDB3O75112 727 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYO1DO94832 1006 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 WDPCPO95876 746 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CPA3P15088 417 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GPR143P51810 404 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PKNOX1P55347 436 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ACER2Q5QJU3 275 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 NUDT13Q86X67 352 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 METTL4Q8N3J2 472 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 APOPT1Q96IL0 206 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 BRF2Q9HAW0 419 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 OXSMQ9NWU1 459 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PHF11Q9UIL8 331 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLLPQ9Y342 182 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 A0A1W2PR48 441 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 DYTNA2CJ06 578 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 FGF17O60258 216 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ESRRBO95718 433 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 KRT6AP02538 564 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GBAP04062 536 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 KRT6BP04259 564 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 UQCRHP07919 91 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 KRT6CP48668 564 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TNFSF10P50591 281 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARG2P78540 354 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms